デフォルトでは、SAS Visual Statisticsは、任意の割り当てられた役割変数で、欠損値を含むすべてのオブザベーションを破棄することにより欠損値を処理します。ただし、線形回帰モデル、ロジスティック回帰モデル、一般化線形モデルのモデルは、有用な欠損プロパティを備えています。場合によっては、オブザベーションに欠損値が含まれているという事実によってモデリングに関連のある情報が提供されることがあります。このプロパティを明示的に選択することで、変数の欠損値を別個の変数としてモデル化できます。尺度変数の場合、欠損値は、平均観測値を使用して推定補完され、欠測を示す指標変数が作成されます。カテゴリ変数では、欠損値は、個別階層とみなされます。